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TECHNICAL ARTICLES蛋白標(biāo)記定量技術(shù)——艾柏森生物
蛋白質(zhì)標(biāo)記定量技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的重要組成部分,它允許科學(xué)家們對(duì)蛋白質(zhì)的表達(dá)水平進(jìn)行精確的測(cè)量和比較。這些技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)研究、藥物開(kāi)發(fā)、疾病診斷等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。以下是一些主要的蛋白質(zhì)標(biāo)記定量技術(shù):
iTRAQ (Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation):這是一種體外標(biāo)記技術(shù),通過(guò)使用不同的同位素標(biāo)簽對(duì)樣品中的肽段進(jìn)行標(biāo)記,然后通過(guò)質(zhì)譜分析比較不同樣品中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量。iTRAQ技術(shù)可以同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量,適用于研究不同病理?xiàng)l件下或不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異 。
TMT (Tandem Mass Tags):與iTRAQ類似,TMT也是一種體外標(biāo)記技術(shù),使用不同的同位素標(biāo)簽對(duì)肽段進(jìn)行標(biāo)記。TMT技術(shù)可以同時(shí)分析多達(dá)10個(gè)樣本,特別適合于比較不同處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析 。
Label-Free Quantitation:這是一種非標(biāo)記定量策略,不依賴于同位素標(biāo)記,而是通過(guò)比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度來(lái)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。這種方法操作簡(jiǎn)單,不需要昂貴的同位素標(biāo)簽,但對(duì)樣品制備和質(zhì)譜操作的質(zhì)量要求較高 。
SILAC (Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture):這是一種體內(nèi)標(biāo)記技術(shù),通過(guò)在細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記的氨基酸,使得新合成的蛋白質(zhì)帶有同位素標(biāo)簽。SILAC技術(shù)可以用于比較不同細(xì)胞狀態(tài)下蛋白質(zhì)的表達(dá)水平 。
SWATH-MS (Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra):這是一種數(shù)據(jù)非依賴型采集模式的質(zhì)譜技術(shù),通過(guò)系統(tǒng)地掃描所有預(yù)定質(zhì)量窗口來(lái)收集質(zhì)譜數(shù)據(jù),提供高通量、高重復(fù)性的定量信息,適合復(fù)雜樣品分析 。
Proximity Labeling:這是一種研究蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù),通過(guò)將具有鄰近標(biāo)記功能的酶與目標(biāo)蛋白融合,將鄰近的蛋白標(biāo)記上生物素,然后通過(guò)親和素磁珠富集生物素標(biāo)記蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,分析目的蛋白的互作或鄰近的蛋白信息 。
MRM (Multiple Reaction Monitoring):這是一種高度選擇性和靈敏度的定量蛋白質(zhì)譜方法,通過(guò)檢測(cè)多個(gè)預(yù)定義的肽段來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)特定蛋白質(zhì)的定量分析。MRM技術(shù)具有靈敏度和準(zhǔn)確性,能夠在復(fù)雜樣品中準(zhǔn)確測(cè)量目標(biāo)蛋白質(zhì)的濃度 。
這些技術(shù)各有優(yōu)勢(shì)和局限性,選擇合適的技術(shù)需要根據(jù)研究目的、樣品類型、實(shí)驗(yàn)條件和預(yù)算等因素綜合考慮。
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