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現(xiàn)如今固相亞磷酰胺三酯法是普遍采用的DNA合成方法,具有高效,快速偶聯(lián)的優(yōu)點。其基本原理是:將核苷酸單體按照3′→5′磷酸二酯鍵鏈接,使其具有天然DNA分子的全部生物學(xué)活性和排列順序。同時,合成過程中將暫時不需要的基團保護起來以防止活躍基團發(fā)生連接反應(yīng)生成副產(chǎn)物,且在下一輪縮合反應(yīng)之前去除保護基以保證不斷形成專一的3′→5′核苷酸排列。
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首先將欲合成的寡核苷酸鏈3′末端核苷(N1)以其3′OH通過1個長的烷基臂與固相載體保護。然后從N1開始逐步地接長寡核苷酸酸鏈:
1. 去保護:以苯磺酸(或三氯醋酸)處理帶有保護基的核苷,去除5′末端的DMTr,暴露出5′OH,經(jīng)洗滌后進行下步反應(yīng)。
2. 耦聯(lián)反應(yīng):加入經(jīng)四唑激活的核苷N2,使之與核苷N1上的5′OH起耦聯(lián)反應(yīng),乙腈洗滌。
3. 加帽反應(yīng):加入醋酐及二甲基氨基吡啶,使未參加反應(yīng)的寡核苷酸鏈(2%以下)乙?;?,乙?;逆湶粎⒓酉乱徊椒磻?yīng),如此有利于純化所需全長的DNA的片段。
4. 氧化反應(yīng):加入碘,使三價的亞磷酸轉(zhuǎn)變?yōu)楦€(wěn)定的五價磷酸。
上述循環(huán)完成之后進行第二個合成循環(huán)。每經(jīng)歷一輪循環(huán),接長1個核苷酸。接長的鏈始終被固定在不溶的固相載體上,過量的未反應(yīng)物或分解物則通過過濾或洗滌除去。當(dāng)整個鏈達到預(yù)定的長度后,從固相載體上切下,氨解法脫去保護基,并經(jīng)過分離純化得到所需要析后產(chǎn)物。
DNA的純化常采用丙烯酰胺凝膠電泳純法,具體操作如下:
1. 從合成柱上洗脫的寡核苷酸片段,冰凍、干燥、去氨水,溶于適量水中后,占樣于15~20%丙烯酰胺凝膠制備膠上,按10V/cm條件電泳,過夜。
2. 電泳完畢后,取下凝膠于EB染色后觀察,或直接將含寡核苷酸片段的凝膠置于硅膠熒光板上(CMC板)紫外線燈下,根據(jù)分子量的標(biāo)準切下所需的區(qū)段(呈黑色),將膠塊置少量緩沖液(10mmol/L Tris-HCl,pH8.0,1mmol/L EDTA 300mmol/L NaCl),搗碎膠塊,25~42℃浸泡過夜(4~24小時),或?qū)⒛z塊置于有少量緩沖液的透析袋中,通電下,寡核苷酸片段即進入透折袋中。
3. 洗脫的寡苷酸核片段以酒精沉淀、洗滌,真空抽干后即可應(yīng)用。
服務(wù)流程如下
1. 序列評定
2. 片段拼接
3. 克隆
4. 篩選
5. 核對測序結(jié)果
6. 凍干粉質(zhì)粒
北京大興亦莊經(jīng)濟開發(fā)區(qū)天驥智谷62號樓603
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