艾柏森生物有專業(yè)生物信息團(tuán)隊(duì)，可以通過(guò)三維建模的方式對(duì)抗原、抗體以及抗原/抗體復(fù)合物進(jìn)行結(jié)構(gòu)生物學(xué)的分析。同時(shí)結(jié)合其他生物信息學(xué)分析方法，提供抗原表位預(yù)測(cè)的服務(wù)。

相關(guān)服務(wù):

★X-射線晶體學(xué)

★通過(guò)肽庫(kù)方法

★通過(guò)LC-MS法

★通過(guò)三維電鏡方法

★基于生物信息學(xué)預(yù)測(cè).

技術(shù)平臺(tái):

★抗體定制服務(wù)平臺(tái)

近年來(lái),發(fā)現(xiàn)一類新的長(zhǎng)約21-25nt的非編碼內(nèi)源性小分子RNA--microRNA(簡(jiǎn)稱miRNA).miRNA的一個(gè)特點(diǎn)是它的前體形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),成熟體在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的一側(cè)上,成熟體序列內(nèi)不能包含大的內(nèi)環(huán)和突環(huán),特別是不能包含大的不對(duì)稱環(huán).miRNA通過(guò)與靶基因mRNA的特定位點(diǎn)互補(bǔ)配對(duì)達(dá)到對(duì)靶基因的降解或翻譯抑制,從而參與基因的表達(dá)調(diào)控.miRNA通常位于基因間隔區(qū)(intergenic region),也有一部分來(lái)源于編碼區(qū)的內(nèi)含子.一些miRNA的基因結(jié)構(gòu)和功能在進(jìn)化中呈現(xiàn)高度的保守性,但是病毒miRNA和其他一些真核生物的miRNA并不具有這種特點(diǎn). 由于miRNA對(duì)生命體具有非常重要的調(diào)控功能,而且近年來(lái)發(fā)現(xiàn),miRNA與人類疾病的發(fā)生有著密切的聯(lián)系,因此尋找新的miRNA是生命科學(xué)領(lǐng)域的一大熱點(diǎn).04年以來(lái),病毒miRNA又成為研究的重點(diǎn).尋找miRNA基因的方法有實(shí)驗(yàn)方法和生物信息學(xué)方法,兩種方法結(jié)合使用,才能準(zhǔn)確地找到miRNA基因.到目前為止,miRBase上公布的miRNA已有5395種,其中病毒的miRNA有130種.然而不同生物中的仍有大量的miRNA基因尚待鑒定,生物信息學(xué)分析手段為發(fā)現(xiàn)新的miRNA基因提供了有效的方法.從2003年出現(xiàn)第一個(gè)miRNA的預(yù)測(cè)工具M(jìn)iRscan后,出現(xiàn)了很多計(jì)算預(yù)測(cè)miRNA的方法,根據(jù)其本質(zhì)可以分為五類:同源片段搜索方法,基于比較基因組學(xué)的預(yù)測(cè)方法,基于序列和結(jié)構(gòu)特征打分的預(yù)測(cè)方法,結(jié)合作用靶標(biāo)的預(yù)測(cè)方法和機(jī)器學(xué)習(xí)方法. 由于不同病毒的miRNA之間序列相似性極低,不同物種miRNA的特點(diǎn)又不盡相同,針對(duì)這一問(wèn)題,我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)預(yù)測(cè)與探尋miRNA基因的計(jì)算機(jī)軟件MiRfilter.MiRfilter是由C#語(yǔ)言編碼,文章詳細(xì)地介紹了它的設(shè)計(jì)流程,重點(diǎn)講述了實(shí)現(xiàn)預(yù)測(cè)的三個(gè)重要算法:發(fā)夾結(jié)構(gòu)判斷算法,篩選成熟體算法和CDS字段搜索算法.并詳盡地講解了它的使用方法.我們用兩種病毒的miRNA檢測(cè)軟件的精度,結(jié)果標(biāo)明MiRfilter精度較高,假陽(yáng)性控制較好.